Участие в проекти на Елена Лилкова
- Търсене на лиганди, деблокиращи вродения имунен отговор в заразени от SARS-CoV-2 вирус клетки (SARSSIM), ФНИ, КП-06-ДК 1/5/2021, участник
- Нов метод за in silico дизайн на пептидни биотерапевтици на базата на циклотиди, ФНИ, КП-06-Китай-10, участник
- Топологични аспекти в динамиката на биологични молекули, ФНИ, КП-06-КОСТ-9/2019, участник
- Разработване и валидиране на in silico метод за идентифициране на биотерапевтици в пептидни смеси с естествен произход, ФНИ, КП-06-ОПР 03-10/2018, участник
- Изследване на HELP механизма на водородно окрехкостяване чрез използване на съвременни високопроизводителни хибридни компютърни архитектури: моделни симулации и експерименталното им валидиране, ФНИ, КП-06-Н27/19/2018, участник
- ННП "Иновативни нискотоксични биологично активни средства за прецизна медицина" (БиоАктивМед), МОН, Д01-217/30.11.2018, участник
- Символни и числени методи, алгоритми и тяхната паралелна реализация за решаване на задачи от математическата физика, ФНИ, ДНТС/Русия 02/7/2018, участник
- Комплексен подход за създаване на нови имуномодулиращи биотерапевтици, ФНИ, ДН 11/20/22.12.2017г., участник
- Компютърно моделиране на взаимодействието на човешки интерферон гама с въглехидрати, Програма за подпомагане на младите учени, БАН, ДФНП-17-146/01.08.2017, ръководител
- Подбор на параметри за ускорено семплиране при молекулно-динамични изследвания на големи биомолекули и биомолекулни комплекси, Програма за подпомагане на младите учени, БАН, ДФНП 99/04.05.2016, ръководител
- Модулен многомащабен метод за моделиране на ново поколение антивирусни и
антибактериални препарати, ФНИ, ДНТС-Китай-01/9/2014, участник
- Суперкомпютърни симулации на свързване на биомолекулни комплекси от гледна точка на имунната активност, ФНИ, ДНТС-Австрия-01-2/2013, участник
- Виртуално и експериментално изследване на взаимодействието на цитокини с техните рецептори, ФНИ, ДМУ 23/03-12.12.2011г, участник
- Развитие на център за върхови постижения “Суперкомпютърни приложения” (Super CA++), ФНИ, ДО02 – 115/15.12.2008 г, участник
- PRACE 1IP, 2IP, 3IP, 4IP, Европейска комисия 7 РМ и Х2020, 1IP: RI-261557, 2IP: RI-283493, 3IP: RI-312763, 4IP: RI-653838, участник